Skogfondskontoen er skogeiers konto, og kontoen kan ikke disponeres uten skogeiers underskrift.

Utbetaling av skogfond skjer enten som refusjon for skogeiers utlegg, eller som oppgjør direkte til entreprenør/leverandør etter skogeiers godkjenning.

Kommunen ser helst at skogeier betaler alle fakturaer selv, og deretter ber om refusjon fra skogfondet. Dette fordi skogeier uansett er den som er ansvarlig for at regningen blir betalt. Kommunen vil ikke ha originalfakturaer, men kopier. Originalene skal skogeier ha til sitt eget regnskap.

For betalte fakturaer som skogeier ønsker refundert, må det og oppgis om mva skal refunderes eller ikke. Et tips her: Det er ikke lønnsomt å betale mva med skogfond, da det ikke gir noen skattefordel. Slik ordningen er i dag med 85 % skattefordel er det mye mer lønnsomt å bruke skogfondet til de tiltakene som gir skattefordel enn til betaling av mva.

Skogfond kan og brukes til å dekke skogeiers egen arbeidsinnsats ved tiltak som er godkjent for bruk av skogfond.